Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cers3Q1A3B0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms