Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc162pQ0VG85 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc162pQ0VG85 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms