Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Itgb8Q0VBD0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms