Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ubxn2bQ0KL01 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms