Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Znf541Q0GGX2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Znf541Q0GGX2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms