Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Cab39Q06138 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Cab39Q06138 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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