Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec23aQ01405 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sec23aQ01405 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms