Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CgnP59242 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CgnP59242 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CgnP59242 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CgnP59242 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms