Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms