Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rrp1P56183 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rrp1P56183 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms