Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TspoP50637 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TspoP50637 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TspoP50637 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TspoP50637 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TspoP50637 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TspoP50637 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TspoP50637 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
TspoP50637 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
TspoP50637 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TspoP50637 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TspoP50637 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms