Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxc13P50207 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Hoxc13P50207 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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