Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cox8bP48772 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms