Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ItgavP43406 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ItgavP43406 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ItgavP43406 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms