Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Rpl28P41105 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Rpl28P41105 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Rpl28P41105 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Rpl28P41105 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
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Rpl28P41105 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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Rpl28P41105 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Rpl28P41105 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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