Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lig1P37913 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms