Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rom1P32958 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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