Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkcdP28867 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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