Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Fcer1aP20489 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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