Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P20040 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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P20040 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P20040 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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P20040 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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P20040 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P20040 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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