Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PcnaP17918 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PcnaP17918 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms