Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim30aP15533 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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