Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Sub1P11031 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sub1P11031 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms