Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CatspereP0DP43 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms