Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PdgfrbP05622 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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