Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClppO88696 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClppO88696 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClppO88696 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms