Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
E2f6O54917 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms