Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Atf6bO35451 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Atf6bO35451 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms