Protein–RNA interactions for Protein: O09111

Ndufb11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 11, mitochondrial, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb11O09111 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb11O09111 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Ndufb11O09111 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Ndufb11O09111 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ndufb11O09111 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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