Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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