Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17078M0QW51 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17078M0QW51 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms