Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20918J3QN17 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms