Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm8005F6YKY3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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