Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ankrd35E9Q9D8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms