Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Krt78E9Q0F0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms