Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Trappc8E9PWG2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms