Protein–RNA interactions for Protein: E9PUB3

Gm5878, Predicted gene 5878, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5878E9PUB3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5878E9PUB3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5878E9PUB3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5878E9PUB3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5878E9PUB3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5878E9PUB3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5878E9PUB3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5878E9PUB3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5878E9PUB3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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