Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm17333C6EQI3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm17333C6EQI3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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