Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clrn2B2RVW2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms