Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Grik3B1AS29 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms