Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
CtcflA2APF3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CtcflA2APF3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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