Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Frmpd1A2AKB4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Frmpd1A2AKB4 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms