Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc183A2AJB1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc183A2AJB1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms