Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Prdm12A2AJ77 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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Prdm12A2AJ77 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Prdm12A2AJ77 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms