Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm14725-201ENSMUST00000120324 828 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Etaa1os-202ENSMUST00000148496 388 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm3238W4VSP7 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms