Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Vamp5Q9Z2P8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Vamp5Q9Z2P8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms