Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Crlf3Q9Z2L7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Crlf3Q9Z2L7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Crlf3Q9Z2L7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crlf3Q9Z2L7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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