Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trip6Q9Z1Y4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms