Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn13Q9Z0S4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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