Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nek3Q9R0A5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Nek3Q9R0A5 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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